W Urzędzie prowadzone są ewidencje i rejestry dotyczące postępowań kontrolnych i karnych skarbowych oraz posiadanego majątku. W Urzędzie prowadzone jest również archiwum zakładowe.

Udostępnianie i wypożyczanie akt z zasobów archiwum zakładowego określa instrukcja w sprawie organizacji i zakresu działania archiwum zakładowego UKS w Poznaniu wprowadzona zarządzeniem nr 33/2007 Dyrektora UKS w Poznaniu z dnia 18 grudnia 2007r.

Dokumentację aktową przechowywaną w archiwum udostępnia się w obecności pracownika archiwum. Akta udostępnia się wyłącznie dla celów służbowych własnych pracowników Urzędu oraz na pisemne żądanie organów kontrolnych, organów ścigania lub wymiaru sprawiedliwości, a także dla celów naukowo-badawczych za zgodą Dyrektora Urzędu.

Informacje gromadzone i przetwarzane w ramach kontroli skarbowej stanowią tajemnicę skarbową - art. 34-34c ustawy z dnia 28 września 1991 r. o kontroli skarbowej (Dz. U. z 2011r. Nr 41, poz. 214 ze zm.).